Сообщается, что Исаев возвращался поездом из командировки в Тамбове в Москву, когда ему стало плохо. Около трех часов ночи на станции Узуново ему вызвали скорую, однако политолог скончался до приезда врачей. Предварительно, причиной смерти стала сердечно-сосудистая недостаточность и остановка сердца.
В марте этого года Исаев посещал Сибай, где успел побывать на карьере и пронаблюдал за семикратным превышением уровня ПДК диоксида серы. «Ощущения при каждом вдохе непередаваемые. Как тут живут люди – не представляю. Искренне сочувствую тем, кто тут находится постоянно», - заявил тогда Исаев.